Protein–RNA interactions for Protein: O94953

KDM4B, Lysine-specific demethylase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4BO94953 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KDM4BO94953 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KDM4BO94953 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KDM4BO94953 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KDM4BO94953 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KDM4BO94953 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KDM4BO94953 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDM4BO94953 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDM4BO94953 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDM4BO94953 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDM4BO94953 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDM4BO94953 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDM4BO94953 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDM4BO94953 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDM4BO94953 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDM4BO94953 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KDM4BO94953 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KDM4BO94953 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KDM4BO94953 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KDM4BO94953 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KDM4BO94953 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KDM4BO94953 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KDM4BO94953 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KDM4BO94953 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KDM4BO94953 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KDM4BO94953 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KDM4BO94953 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KDM4BO94953 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KDM4BO94953 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KDM4BO94953 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KDM4BO94953 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KDM4BO94953 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KDM4BO94953 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KDM4BO94953 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KDM4BO94953 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KDM4BO94953 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM4BO94953 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KDM4BO94953 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms