Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DKK1O94907 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DKK1O94907 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DKK1O94907 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DKK1O94907 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DKK1O94907 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DKK1O94907 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DKK1O94907 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DKK1O94907 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DKK1O94907 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DKK1O94907 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DKK1O94907 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DKK1O94907 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DKK1O94907 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DKK1O94907 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DKK1O94907 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DKK1O94907 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DKK1O94907 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DKK1O94907 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DKK1O94907 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DKK1O94907 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DKK1O94907 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DKK1O94907 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DKK1O94907 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DKK1O94907 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DKK1O94907 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DKK1O94907 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DKK1O94907 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DKK1O94907 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DKK1O94907 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DKK1O94907 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DKK1O94907 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DKK1O94907 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DKK1O94907 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DKK1O94907 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DKK1O94907 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DKK1O94907 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DKK1O94907 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DKK1O94907 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DKK1O94907 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DKK1O94907 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DKK1O94907 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DKK1O94907 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DKK1O94907 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DKK1O94907 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DKK1O94907 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DKK1O94907 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DKK1O94907 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DKK1O94907 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DKK1O94907 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DKK1O94907 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DKK1O94907 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DKK1O94907 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DKK1O94907 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DKK1O94907 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DKK1O94907 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DKK1O94907 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DKK1O94907 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DKK1O94907 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DKK1O94907 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DKK1O94907 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DKK1O94907 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DKK1O94907 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DKK1O94907 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DKK1O94907 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DKK1O94907 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DKK1O94907 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DKK1O94907 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DKK1O94907 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DKK1O94907 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DKK1O94907 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DKK1O94907 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DKK1O94907 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DKK1O94907 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DKK1O94907 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DKK1O94907 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DKK1O94907 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DKK1O94907 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DKK1O94907 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DKK1O94907 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DKK1O94907 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DKK1O94907 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DKK1O94907 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DKK1O94907 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DKK1O94907 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DKK1O94907 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DKK1O94907 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DKK1O94907 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DKK1O94907 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DKK1O94907 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DKK1O94907 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DKK1O94907 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DKK1O94907 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DKK1O94907 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DKK1O94907 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DKK1O94907 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DKK1O94907 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DKK1O94907 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DKK1O94907 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DKK1O94907 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms