Protein–RNA interactions for Protein: O75764

TCEA3, Transcription elongation factor A protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA3O75764 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCEA3O75764 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCEA3O75764 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCEA3O75764 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCEA3O75764 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCEA3O75764 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCEA3O75764 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCEA3O75764 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCEA3O75764 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCEA3O75764 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCEA3O75764 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCEA3O75764 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCEA3O75764 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCEA3O75764 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCEA3O75764 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCEA3O75764 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCEA3O75764 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCEA3O75764 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCEA3O75764 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TCEA3O75764 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCEA3O75764 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms