Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIA4O75335 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPFIA4O75335 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms