Protein–RNA interactions for Protein: O75074

LRP3, Low-density lipoprotein receptor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3O75074 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP3O75074 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP3O75074 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP3O75074 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP3O75074 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP3O75074 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP3O75074 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP3O75074 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP3O75074 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP3O75074 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP3O75074 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP3O75074 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP3O75074 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP3O75074 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP3O75074 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP3O75074 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP3O75074 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP3O75074 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP3O75074 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP3O75074 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP3O75074 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP3O75074 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP3O75074 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP3O75074 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP3O75074 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP3O75074 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP3O75074 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP3O75074 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP3O75074 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP3O75074 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP3O75074 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP3O75074 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRP3O75074 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LRP3O75074 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRP3O75074 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LRP3O75074 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRP3O75074 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRP3O75074 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRP3O75074 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRP3O75074 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRP3O75074 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRP3O75074 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRP3O75074 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRP3O75074 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRP3O75074 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LRP3O75074 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRP3O75074 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRP3O75074 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRP3O75074 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRP3O75074 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRP3O75074 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRP3O75074 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRP3O75074 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRP3O75074 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRP3O75074 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRP3O75074 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRP3O75074 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRP3O75074 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRP3O75074 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRP3O75074 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRP3O75074 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRP3O75074 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRP3O75074 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRP3O75074 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRP3O75074 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRP3O75074 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRP3O75074 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRP3O75074 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRP3O75074 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRP3O75074 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRP3O75074 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRP3O75074 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRP3O75074 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRP3O75074 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRP3O75074 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRP3O75074 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRP3O75074 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRP3O75074 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRP3O75074 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LRP3O75074 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRP3O75074 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP3O75074 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP3O75074 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP3O75074 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP3O75074 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRP3O75074 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRP3O75074 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRP3O75074 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRP3O75074 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRP3O75074 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP3O75074 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP3O75074 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP3O75074 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRP3O75074 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRP3O75074 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRP3O75074 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRP3O75074 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRP3O75074 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRP3O75074 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRP3O75074 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms