Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 NEK6-206ENST00000422297 799 ntTSL 315.72■□□□□ 0.112e-16■■■■■ 46.8
DKC1O60832 NEK6-202ENST00000373596 758 ntTSL 314.6□□□□□ -0.072e-16■■■■■ 46.8
DKC1O60832 NEK6-207ENST00000423785 726 ntTSL 513.82□□□□□ -0.22e-16■■■■■ 46.8
DKC1O60832 NEK6-213ENST00000540326 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.32e-16■■■■■ 46.8
DKC1O60832 NEK6-208ENST00000425237 806 ntTSL 312.91□□□□□ -0.342e-16■■■■■ 46.8
DKC1O60832 NEK6-205ENST00000394199 2535 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.392e-16■■■■■ 46.8
DKC1O60832 NEK6-203ENST00000373600 3619 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.422e-16■■■■■ 46.8
DKC1O60832 NEK6-212ENST00000539416 2582 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.422e-16■■■■■ 46.8
DKC1O60832 NEK6-201ENST00000320246 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.512e-16■■■■■ 46.8
DKC1O60832 NEK6-215ENST00000546191 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.752e-16■■■■■ 46.8
DKC1O60832 NEK6-204ENST00000373603 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.882e-16■■■■■ 46.8
DKC1O60832 CTNNA3-204ENST00000494580 470 ntTSL 35.54□□□□□ -1.523e-8■■■■■ 46.7
DKC1O60832 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.573e-8■■■■■ 46.7
DKC1O60832 AGPAT3-213ENST00000479117 1510 ntTSL 519.66■□□□□ 0.743e-7■■■■■ 46.7
DKC1O60832 AGPAT3-215ENST00000484865 588 ntTSL 213.6□□□□□ -0.233e-7■■■■■ 46.7
DKC1O60832 AGPAT3-211ENST00000467358 3955 ntTSL 211.63□□□□□ -0.553e-7■■■■■ 46.7
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DKC1O60832 UBAP2L-207ENST00000428931 3988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.541e-323■■■■■ 46.7
DKC1O60832 UBAP2L-212ENST00000465855 684 ntTSL 311.52□□□□□ -0.571e-323■■■■■ 46.7
DKC1O60832 UBAP2L-201ENST00000271877 3997 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.751e-323■■■■■ 46.7
DKC1O60832 UBAP2L-208ENST00000433615 1789 ntTSL 1 (best)9.8□□□□□ -0.841e-323■■■■■ 46.7
DKC1O60832 UBAP2L-202ENST00000343815 3411 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.931e-323■■■■■ 46.7
DKC1O60832 UBAP2L-220ENST00000613315 3451 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.931e-323■■■■■ 46.7
DKC1O60832 UBAP2L-215ENST00000484696 611 ntTSL 29□□□□□ -0.971e-323■■■■■ 46.7
DKC1O60832 UBAP2L-203ENST00000361546 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.031e-323■■■■■ 46.7
DKC1O60832 UBAP2L-219ENST00000495676 867 ntTSL 35.92□□□□□ -1.461e-323■■■■■ 46.7
DKC1O60832 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.64□□□□□ -1.511e-323■■■■■ 46.7
DKC1O60832 FZR1-207ENST00000591290 1331 ntTSL 522.14■■□□□ 1.144e-7■■■■■ 46.6
DKC1O60832 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.84e-7■■■■■ 46.6
DKC1O60832 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.744e-7■■■■■ 46.6
DKC1O60832 FZR1-208ENST00000592214 598 ntTSL 317.6■□□□□ 0.414e-7■■■■■ 46.6
DKC1O60832 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.244e-7■■■■■ 46.6
DKC1O60832 SMYD3-212ENST00000483072 466 ntTSL 29.72□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 46.6
DKC1O60832 SMYD3-201ENST00000366516 1863 ntTSL 1 (best)9.51□□□□□ -0.892e-6■■■■■ 46.6
DKC1O60832 SMYD3-202ENST00000366517 1372 ntTSL 1 (best)8.33□□□□□ -1.082e-6■■■■■ 46.6
DKC1O60832 SMYD3-217ENST00000493441 823 ntTSL 28.28□□□□□ -1.082e-6■■■■■ 46.6
DKC1O60832 SMYD3-209ENST00000470510 1042 ntTSL 58.05□□□□□ -1.122e-6■■■■■ 46.6
DKC1O60832 SMYD3-215ENST00000490322 368 ntTSL 33.05□□□□□ -1.922e-6■■■■■ 46.6
DKC1O60832 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.44e-8■■■■■ 46.6
DKC1O60832 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.157e-7■■■■■ 46.5
DKC1O60832 ELP1-204ENST00000537196 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.347e-7■■■■■ 46.5
DKC1O60832 GAS5-204ENST00000421068 1060 ntTSL 24.21□□□□□ -1.749e-54■■■■■ 46.3
DKC1O60832 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.811e-323■■■■■ 46.3
DKC1O60832 EIF5-203ENST00000558265 872 ntTSL 515.59■□□□□ 0.091e-323■■■■■ 46.3
DKC1O60832 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.011e-323■■■■■ 46.3
DKC1O60832 EIF5-205ENST00000558506 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.151e-323■■■■■ 46.3
DKC1O60832 EIF5-221ENST00000561439 719 ntTSL 28.91□□□□□ -0.981e-323■■■■■ 46.3
DKC1O60832 EIF5-217ENST00000561023 565 ntTSL 25.12□□□□□ -1.591e-323■■■■■ 46.3
DKC1O60832 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.48□□□□□ -2.171e-323■■■■■ 46.3
DKC1O60832 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.826e-8■■■■■ 46.2
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DKC1O60832 MCC-205ENST00000506605 857 ntTSL 217.6■□□□□ 0.416e-8■■■■■ 46.2
DKC1O60832 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.056e-8■■■■■ 46.2
DKC1O60832 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.186e-8■■■■■ 46.2
DKC1O60832 MCC-209ENST00000515367 3844 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.956e-8■■■■■ 46.2
DKC1O60832 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.092e-8■■■■■ 46.1
DKC1O60832 MPRIP-210ENST00000577514 513 ntTSL 525.32■■□□□ 1.642e-19■■■■■ 46.1
DKC1O60832 MPRIP-204ENST00000395807 926 ntTSL 223.79■■□□□ 1.42e-19■■■■■ 46.1
DKC1O60832 ADAP1-203ENST00000437486 622 ntTSL 522.9■■□□□ 1.262e-8■■■■■ 46.1
DKC1O60832 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.12e-8■■■■■ 46.1
DKC1O60832 ADAP1-215ENST00000495809 2236 ntTSL 221.3■■□□□ 12e-8■■■■■ 46.1
DKC1O60832 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.972e-8■■■■■ 46.1
DKC1O60832 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.952e-8■■■■■ 46.1
DKC1O60832 ADAP1-204ENST00000446141 2085 ntTSL 220.71■□□□□ 0.912e-8■■■■■ 46.1
DKC1O60832 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.832e-8■■■■■ 46.1
DKC1O60832 ADAP1-211ENST00000478000 2192 ntTSL 519.76■□□□□ 0.752e-8■■■■■ 46.1
DKC1O60832 COX19-202ENST00000457254 1420 ntTSL 218.88■□□□□ 0.612e-8■■■■■ 46.1
DKC1O60832 ADAP1-206ENST00000453175 742 ntTSL 517.72■□□□□ 0.432e-8■■■■■ 46.1
DKC1O60832 COL9A2-208ENST00000488463 1005 ntTSL 515.9■□□□□ 0.148e-10■■■■■ 46.1
DKC1O60832 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.058e-10■■■■■ 46.1
DKC1O60832 COL9A2-207ENST00000482722 2887 ntTSL 1 (best)14.81□□□□□ -0.048e-10■■■■■ 46.1
DKC1O60832 ADAP1-208ENST00000454383 576 ntTSL 413.99□□□□□ -0.172e-8■■■■■ 46.1
DKC1O60832 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.25e-6■■■■■ 46.1
DKC1O60832 DSCAML1-202ENST00000525836 583 ntTSL 324.62■■□□□ 1.538e-8■■■■■ 46.1
DKC1O60832 FXYD2-204ENST00000514385 2872 ntTSL 1 (best)12.69□□□□□ -0.388e-8■■■■■ 46.1
DKC1O60832 FXYD2-206ENST00000532119 562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.048e-8■■■■■ 46.1
DKC1O60832 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 46.1
DKC1O60832 RXRA-203ENST00000484822 5215 ntTSL 216.6■□□□□ 0.259e-7■■■■■ 46.1
DKC1O60832 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.06□□□□□ -2.244e-48■■■■■ 46.1
DKC1O60832 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.482e-7■■■■■ 46
DKC1O60832 ANKRD11-204ENST00000378332 1982 ntTSL 223.34■■□□□ 1.332e-7■■■■■ 46
DKC1O60832 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 46
DKC1O60832 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 46
DKC1O60832 ANKRD11-207ENST00000562816 573 ntTSL 412.72□□□□□ -0.372e-7■■■■■ 46
DKC1O60832 INPP5A-204ENST00000423490 416 ntTSL 56.3□□□□□ -1.42e-6■■■■■ 45.8
DKC1O60832 ZNF778-203ENST00000564906 568 ntTSL 422.32■■□□□ 1.164e-7■■■■■ 45.8
DKC1O60832 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.134e-7■■■■■ 45.8
DKC1O60832 ZNF778-206ENST00000567651 1431 ntTSL 1 (best)12.6□□□□□ -0.394e-7■■■■■ 45.8
DKC1O60832 ZNF778-207ENST00000620195 11031 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.854e-7■■■■■ 45.8
DKC1O60832 ZNF778-201ENST00000306502 2386 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.94e-7■■■■■ 45.8
DKC1O60832 AGAP1-208ENST00000448025 757 ntTSL 510.34□□□□□ -0.752e-7■■■■■ 45.7
DKC1O60832 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.215e-7■■■■■ 45.7
DKC1O60832 RPTOR-209ENST00000575542 5536 ntTSL 1 (best)17.39■□□□□ 0.373e-6■■■■■ 45.6
DKC1O60832 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.23e-37■■■■■ 45.6
DKC1O60832 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.855e-11■■■■■ 45.5
DKC1O60832 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.175e-11■■■■■ 45.5
DKC1O60832 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 45.4
DKC1O60832 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.892e-7■■■■■ 45.4
DKC1O60832 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.129e-7■■■■■ 45.4
DKC1O60832 MCF2L-223ENST00000473345 399 ntTSL 310.64□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 45.3
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