Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC28A2O43868 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC28A2O43868 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms