Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLX3O43711 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLX3O43711 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLX3O43711 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLX3O43711 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLX3O43711 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLX3O43711 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLX3O43711 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLX3O43711 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLX3O43711 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLX3O43711 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLX3O43711 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLX3O43711 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLX3O43711 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLX3O43711 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLX3O43711 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLX3O43711 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLX3O43711 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLX3O43711 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLX3O43711 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLX3O43711 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLX3O43711 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLX3O43711 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLX3O43711 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLX3O43711 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLX3O43711 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLX3O43711 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TLX3O43711 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLX3O43711 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLX3O43711 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLX3O43711 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLX3O43711 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLX3O43711 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLX3O43711 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLX3O43711 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TLX3O43711 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLX3O43711 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLX3O43711 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLX3O43711 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLX3O43711 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLX3O43711 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TLX3O43711 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLX3O43711 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLX3O43711 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLX3O43711 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLX3O43711 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLX3O43711 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLX3O43711 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLX3O43711 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLX3O43711 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLX3O43711 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLX3O43711 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLX3O43711 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLX3O43711 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLX3O43711 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLX3O43711 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLX3O43711 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLX3O43711 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLX3O43711 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLX3O43711 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLX3O43711 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLX3O43711 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLX3O43711 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLX3O43711 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLX3O43711 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLX3O43711 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TLX3O43711 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLX3O43711 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLX3O43711 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLX3O43711 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLX3O43711 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLX3O43711 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLX3O43711 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLX3O43711 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLX3O43711 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLX3O43711 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLX3O43711 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLX3O43711 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLX3O43711 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TLX3O43711 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TLX3O43711 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLX3O43711 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLX3O43711 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLX3O43711 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TLX3O43711 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLX3O43711 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLX3O43711 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLX3O43711 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLX3O43711 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLX3O43711 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TLX3O43711 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLX3O43711 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLX3O43711 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLX3O43711 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLX3O43711 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLX3O43711 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLX3O43711 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLX3O43711 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TLX3O43711 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TLX3O43711 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms