Protein–RNA interactions for Protein: O43474

KLF4, Krueppel-like factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF4O43474 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF4O43474 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF4O43474 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF4O43474 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF4O43474 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF4O43474 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF4O43474 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF4O43474 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF4O43474 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF4O43474 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF4O43474 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF4O43474 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF4O43474 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF4O43474 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF4O43474 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLF4O43474 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLF4O43474 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLF4O43474 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KLF4O43474 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KLF4O43474 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLF4O43474 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLF4O43474 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLF4O43474 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF4O43474 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF4O43474 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF4O43474 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF4O43474 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF4O43474 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF4O43474 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF4O43474 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF4O43474 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF4O43474 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF4O43474 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF4O43474 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF4O43474 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF4O43474 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF4O43474 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF4O43474 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF4O43474 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF4O43474 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF4O43474 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF4O43474 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF4O43474 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF4O43474 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF4O43474 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF4O43474 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KLF4O43474 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KLF4O43474 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF4O43474 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF4O43474 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF4O43474 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF4O43474 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF4O43474 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF4O43474 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF4O43474 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF4O43474 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF4O43474 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF4O43474 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF4O43474 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF4O43474 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF4O43474 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF4O43474 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF4O43474 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF4O43474 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF4O43474 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF4O43474 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF4O43474 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF4O43474 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF4O43474 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF4O43474 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF4O43474 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF4O43474 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF4O43474 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF4O43474 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF4O43474 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF4O43474 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF4O43474 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF4O43474 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF4O43474 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF4O43474 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF4O43474 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF4O43474 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF4O43474 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF4O43474 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF4O43474 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF4O43474 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF4O43474 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF4O43474 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF4O43474 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF4O43474 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF4O43474 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF4O43474 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF4O43474 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF4O43474 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF4O43474 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF4O43474 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF4O43474 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF4O43474 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF4O43474 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF4O43474 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms