Protein–RNA interactions for Protein: O43164

PJA2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA2O43164 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PJA2O43164 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PJA2O43164 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PJA2O43164 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PJA2O43164 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PJA2O43164 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PJA2O43164 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PJA2O43164 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PJA2O43164 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PJA2O43164 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PJA2O43164 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PJA2O43164 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PJA2O43164 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PJA2O43164 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PJA2O43164 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PJA2O43164 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PJA2O43164 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PJA2O43164 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PJA2O43164 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PJA2O43164 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PJA2O43164 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PJA2O43164 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PJA2O43164 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PJA2O43164 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PJA2O43164 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PJA2O43164 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PJA2O43164 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PJA2O43164 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PJA2O43164 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PJA2O43164 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PJA2O43164 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PJA2O43164 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PJA2O43164 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PJA2O43164 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PJA2O43164 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PJA2O43164 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PJA2O43164 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PJA2O43164 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PJA2O43164 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PJA2O43164 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PJA2O43164 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PJA2O43164 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PJA2O43164 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PJA2O43164 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PJA2O43164 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PJA2O43164 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PJA2O43164 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PJA2O43164 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PJA2O43164 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PJA2O43164 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PJA2O43164 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PJA2O43164 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PJA2O43164 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PJA2O43164 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PJA2O43164 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PJA2O43164 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PJA2O43164 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PJA2O43164 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PJA2O43164 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PJA2O43164 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PJA2O43164 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PJA2O43164 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PJA2O43164 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PJA2O43164 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PJA2O43164 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PJA2O43164 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PJA2O43164 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PJA2O43164 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PJA2O43164 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PJA2O43164 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PJA2O43164 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PJA2O43164 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PJA2O43164 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PJA2O43164 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PJA2O43164 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PJA2O43164 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PJA2O43164 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PJA2O43164 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PJA2O43164 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PJA2O43164 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PJA2O43164 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PJA2O43164 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PJA2O43164 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PJA2O43164 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PJA2O43164 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PJA2O43164 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PJA2O43164 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PJA2O43164 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PJA2O43164 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PJA2O43164 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PJA2O43164 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PJA2O43164 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PJA2O43164 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PJA2O43164 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PJA2O43164 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PJA2O43164 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PJA2O43164 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PJA2O43164 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PJA2O43164 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PJA2O43164 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms