Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

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Length 1,643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
KDM6BO15054 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
KDM6BO15054 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
KDM6BO15054 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
KDM6BO15054 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
KDM6BO15054 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
KDM6BO15054 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
KDM6BO15054 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
KDM6BO15054 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
KDM6BO15054 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
KDM6BO15054 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
KDM6BO15054 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
KDM6BO15054 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
KDM6BO15054 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
KDM6BO15054 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
KDM6BO15054 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
KDM6BO15054 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
KDM6BO15054 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
KDM6BO15054 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
KDM6BO15054 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
KDM6BO15054 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
KDM6BO15054 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
KDM6BO15054 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
KDM6BO15054 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
KDM6BO15054 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
KDM6BO15054 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
KDM6BO15054 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
KDM6BO15054 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
KDM6BO15054 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
KDM6BO15054 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
KDM6BO15054 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
KDM6BO15054 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
KDM6BO15054 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
KDM6BO15054 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
KDM6BO15054 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
KDM6BO15054 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
KDM6BO15054 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
KDM6BO15054 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
KDM6BO15054 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
KDM6BO15054 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
KDM6BO15054 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
KDM6BO15054 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
KDM6BO15054 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
KDM6BO15054 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
KDM6BO15054 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
KDM6BO15054 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
KDM6BO15054 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
KDM6BO15054 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
KDM6BO15054 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
KDM6BO15054 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
KDM6BO15054 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
KDM6BO15054 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
KDM6BO15054 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
KDM6BO15054 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
KDM6BO15054 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
KDM6BO15054 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
KDM6BO15054 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
KDM6BO15054 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
KDM6BO15054 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
KDM6BO15054 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
KDM6BO15054 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
KDM6BO15054 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
KDM6BO15054 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
KDM6BO15054 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
KDM6BO15054 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
KDM6BO15054 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
KDM6BO15054 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
KDM6BO15054 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
KDM6BO15054 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
KDM6BO15054 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
KDM6BO15054 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
KDM6BO15054 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
KDM6BO15054 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
KDM6BO15054 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
KDM6BO15054 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
KDM6BO15054 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
KDM6BO15054 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
KDM6BO15054 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
KDM6BO15054 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
KDM6BO15054 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
KDM6BO15054 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
KDM6BO15054 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
KDM6BO15054 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
KDM6BO15054 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
KDM6BO15054 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
KDM6BO15054 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
KDM6BO15054 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
KDM6BO15054 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
KDM6BO15054 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
KDM6BO15054 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
KDM6BO15054 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
KDM6BO15054 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
KDM6BO15054 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
KDM6BO15054 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
KDM6BO15054 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
KDM6BO15054 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
KDM6BO15054 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
KDM6BO15054 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
KDM6BO15054 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
KDM6BO15054 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
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