Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOCS6O14544 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOCS6O14544 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOCS6O14544 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms