Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TXNDC9O14530 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNDC9O14530 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms