Protein–RNA interactions for Protein: C9JCJ5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9JCJ5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9JCJ5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9JCJ5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9JCJ5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9JCJ5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9JCJ5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9JCJ5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9JCJ5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C9JCJ5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9JCJ5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9JCJ5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9JCJ5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9JCJ5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9JCJ5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9JCJ5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9JCJ5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9JCJ5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C9JCJ5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9JCJ5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9JCJ5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9JCJ5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9JCJ5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9JCJ5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9JCJ5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9JCJ5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9JCJ5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9JCJ5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9JCJ5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9JCJ5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9JCJ5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9JCJ5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9JCJ5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9JCJ5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9JCJ5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9JCJ5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9JCJ5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9JCJ5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9JCJ5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9JCJ5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9JCJ5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9JCJ5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9JCJ5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9JCJ5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9JCJ5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9JCJ5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9JCJ5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9JCJ5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9JCJ5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9JCJ5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9JCJ5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9JCJ5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9JCJ5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9JCJ5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9JCJ5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9JCJ5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9JCJ5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9JCJ5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9JCJ5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9JCJ5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9JCJ5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9JCJ5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9JCJ5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9JCJ5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9JCJ5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9JCJ5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9JCJ5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9JCJ5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9JCJ5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9JCJ5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9JCJ5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
C9JCJ5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C9JCJ5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C9JCJ5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9JCJ5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9JCJ5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9JCJ5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C9JCJ5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9JCJ5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9JCJ5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9JCJ5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9JCJ5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9JCJ5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9JCJ5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9JCJ5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9JCJ5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9JCJ5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C9JCJ5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9JCJ5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9JCJ5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9JCJ5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9JCJ5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9JCJ5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C9JCJ5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9JCJ5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9JCJ5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9JCJ5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9JCJ5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9JCJ5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9JCJ5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9JCJ5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms