Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RGPD3A6NKT7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RGPD3A6NKT7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RGPD3A6NKT7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RGPD3A6NKT7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RGPD3A6NKT7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RGPD3A6NKT7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RGPD3A6NKT7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RGPD3A6NKT7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RGPD3A6NKT7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RGPD3A6NKT7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
RGPD3A6NKT7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RGPD3A6NKT7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RGPD3A6NKT7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
RGPD3A6NKT7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RGPD3A6NKT7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
RGPD3A6NKT7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RGPD3A6NKT7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RGPD3A6NKT7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RGPD3A6NKT7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RGPD3A6NKT7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RGPD3A6NKT7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RGPD3A6NKT7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RGPD3A6NKT7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RGPD3A6NKT7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RGPD3A6NKT7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RGPD3A6NKT7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
RGPD3A6NKT7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RGPD3A6NKT7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RGPD3A6NKT7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RGPD3A6NKT7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RGPD3A6NKT7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RGPD3A6NKT7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RGPD3A6NKT7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
RGPD3A6NKT7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RGPD3A6NKT7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RGPD3A6NKT7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RGPD3A6NKT7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RGPD3A6NKT7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RGPD3A6NKT7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RGPD3A6NKT7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RGPD3A6NKT7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RGPD3A6NKT7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RGPD3A6NKT7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.64■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
RGPD3A6NKT7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RGPD3A6NKT7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RGPD3A6NKT7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RGPD3A6NKT7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
RGPD3A6NKT7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
RGPD3A6NKT7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RGPD3A6NKT7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RGPD3A6NKT7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RGPD3A6NKT7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RGPD3A6NKT7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RGPD3A6NKT7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RGPD3A6NKT7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RGPD3A6NKT7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RGPD3A6NKT7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RGPD3A6NKT7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RGPD3A6NKT7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RGPD3A6NKT7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RGPD3A6NKT7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
RGPD3A6NKT7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RGPD3A6NKT7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RGPD3A6NKT7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RGPD3A6NKT7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms