Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HELTA6NFD8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms