Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LCHNA4D1U4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LCHNA4D1U4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LCHNA4D1U4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms