Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HHLA3Q9XRX5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms