Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms