Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J2

C16orf62, UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62Q7Z3J2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf62Q7Z3J2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms