Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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