Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB1Q14028 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
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