Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.284e-6■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.074e-6■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.034e-6■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16.69■□□□□ 0.262e-17■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 MLH1-201ENST00000231790 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.542e-17■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 MLH1-221ENST00000536378 2567 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.582e-17■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 MLH1-222ENST00000539477 2366 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.672e-17■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 MLH1-216ENST00000458205 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.682e-17■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 MLH1-213ENST00000456676 2230 ntTSL 1 (best)9.89□□□□□ -0.832e-17■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.162e-17■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.672e-17■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 CERS2-209ENST00000482825 1618 ntTSL 515.36■□□□□ 0.055e-7■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 CERS2-214ENST00000561294 1803 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.175e-7■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 CERS2-213ENST00000560793 1661 ntTSL 1 (best)13.22□□□□□ -0.295e-7■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.612e-22■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.152e-22■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.142e-6■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.52e-7■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.633e-13■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.13e-6■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.13e-6■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 RNF181-205ENST00000456023 559 ntTSL 315.67■□□□□ 0.13e-6■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 RNF181-204ENST00000443647 535 ntTSL 212.48□□□□□ -0.413e-6■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.154e-7■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -04e-7■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.034e-7■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 NRDC-203ENST00000440943 1660 ntTSL 59.56□□□□□ -0.884e-7■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 NRDC-210ENST00000485608 3149 ntTSL 27.9□□□□□ -1.144e-7■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.344e-7■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 PIEZO1-203ENST00000419505 1635 ntTSL 1 (best)23.49■■□□□ 1.358e-7■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.188e-7■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 PIEZO1-208ENST00000484567 2464 ntTSL 219.75■□□□□ 0.758e-7■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.438e-7■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.196e-6■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 DENND4B-208ENST00000480340 2530 ntTSL 215.73■□□□□ 0.116e-6■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 TPT1-201ENST00000309246 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.021e-45■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 EIF4A1-218ENST00000581544 1444 ntTSL 212.71□□□□□ -0.377e-14■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.296e-7■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 HELZ-206ENST00000579953 6365 ntTSL 26.85□□□□□ -1.316e-7■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 DNAJC6-202ENST00000371069 5365 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.512e-7■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.042e-7■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.182e-7■■□□□ 11.5
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PABPC4Q13310 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.124e-7■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.042e-8■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.014e-7■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.744e-7■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.434e-7■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.92e-8■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.772e-8■■□□□ 11.5
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PABPC4Q13310 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.76■□□□□ 0.594e-7■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 CTSA-207ENST00000484855 2183 ntTSL 1 (best)18.62■□□□□ 0.572e-8■■□□□ 11.5
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PABPC4Q13310 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.432e-8■■□□□ 11.5
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PABPC4Q13310 RPS13-201ENST00000228140 491 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.371e-29■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 RPS13-202ENST00000525634 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.581e-29■■□□□ 11.5
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PABPC4Q13310 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.436e-6■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.695e-9■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 PABPC4-210ENST00000470443 1212 ntTSL 57.57□□□□□ -1.23e-9■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.881e-22■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.221e-22■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41e-6■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 ATG9A-203ENST00000409033 3701 ntTSL 1 (best)14.02□□□□□ -0.171e-6■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 ATG9A-202ENST00000396761 3799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.551e-6■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 RPS2-216ENST00000534461 734 ntTSL 222.15■■□□□ 1.143e-50■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.033e-7■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.77e-10■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 SPC24-207ENST00000592967 833 ntTSL 319.42■□□□□ 0.77e-10■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 SPC24-203ENST00000585567 633 ntTSL 318.62■□□□□ 0.577e-10■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 SPC24-205ENST00000591396 832 ntTSL 517.61■□□□□ 0.417e-10■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.778e-15■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 CXXC5-208ENST00000505812 353 ntTSL 213.93□□□□□ -0.188e-15■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 CARHSP1-215ENST00000570125 681 ntTSL 433.97■■■■□ 3.037e-9■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 CARHSP1-206ENST00000563815 1913 ntTSL 221.67■■□□□ 1.067e-9■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.057e-9■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 CARHSP1-213ENST00000569398 442 ntTSL 218.03■□□□□ 0.487e-9■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 CARHSP1-212ENST00000568968 461 ntTSL 217.79■□□□□ 0.447e-9■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 CARHSP1-211ENST00000568117 521 ntTSL 317.19■□□□□ 0.347e-9■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 CARHSP1-210ENST00000567908 565 ntTSL 216.83■□□□□ 0.287e-9■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 CARHSP1-207ENST00000565287 556 ntTSL 316.39■□□□□ 0.217e-9■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.364e-10■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.344e-10■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 AKT2-218ENST00000483166 4454 ntTSL 214.34□□□□□ -0.114e-10■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 AKT2-216ENST00000476266 3309 ntTSL 513.61□□□□□ -0.234e-10■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 RPS4X-203ENST00000470671 610 ntTSL 33.78□□□□□ -1.82e-34■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 NCL-207ENST00000461347 3967 ntTSL 215.85■□□□□ 0.137e-24■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 OAZ1-204ENST00000588673 780 ntTSL 324.39■■□□□ 1.494e-10■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 OAZ1-205ENST00000589361 679 ntTSL 1 (best)19■□□□□ 0.634e-10■■□□□ 11.5
PABPC4Q13310 RPS7-207ENST00000479123 511 ntTSL 1 (best)18.8■□□□□ 0.65e-9■■□□□ 11.5
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