Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COMMD5Q9GZQ3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms