Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.39■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms