Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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