Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIBP1Q86W92 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms