Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 REV3L-202ENST00000368802 10701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.81e-6■■■□□ 18.6
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PCBP2Q15366 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.221e-6■■■□□ 18.6
PCBP2Q15366 REV3L-206ENST00000434009 10644 ntTSL 22.42□□□□□ -2.021e-6■■■□□ 18.6
PCBP2Q15366 CTDSP1-207ENST00000473420 922 ntTSL 318.22■□□□□ 0.512e-6■■■□□ 18.5
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PCBP2Q15366 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.052e-6■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 CTDSP1-210ENST00000491064 786 ntTSL 312.59□□□□□ -0.392e-6■■■□□ 18.5
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PCBP2Q15366 PLEKHB1-220ENST00000545106 813 ntTSL 218.95■□□□□ 0.624e-10■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.174e-10■■■□□ 18.5
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PCBP2Q15366 CMSS1-208ENST00000496116 2145 ntTSL 1 (best)10.95□□□□□ -0.668e-7■■■□□ 18.5
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PCBP2Q15366 CMSS1-206ENST00000491299 881 ntTSL 58.01□□□□□ -1.138e-7■■■□□ 18.5
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PCBP2Q15366 NCDN-202ENST00000373243 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.551e-6■■■□□ 18.5
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PCBP2Q15366 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.231e-8■■■□□ 18.5
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PCBP2Q15366 MFAP3-212ENST00000522782 643 ntTSL 1 (best)7.58□□□□□ -1.21e-8■■■□□ 18.5
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PCBP2Q15366 FTX-215ENST00000638681 9771 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.949e-7■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 FTX-206ENST00000602420 751 ntTSL 35.44□□□□□ -1.549e-7■■■□□ 18.5
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PCBP2Q15366 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.453e-6■■■□□ 18.5
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PCBP2Q15366 PHF20-202ENST00000374000 1814 ntTSL 1 (best)10.54□□□□□ -0.723e-6■■■□□ 18.5
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PCBP2Q15366 TMC6-221ENST00000592063 743 ntTSL 513.06□□□□□ -0.321e-6■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.992e-8■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 FHL3-205ENST00000485803 1468 ntTSL 1 (best)16.29■□□□□ 0.22e-8■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 SMG7-204ENST00000419169 2483 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.19■□□□□ 0.344e-6■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.44e-6■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.724e-8■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.274e-8■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.024e-8■■■□□ 18.5
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PCBP2Q15366 CD276-216ENST00000563584 505 ntTSL 517.23■□□□□ 0.351e-6■■■□□ 18.5
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PCBP2Q15366 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.531e-6■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.054e-7■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.254e-7■■■□□ 18.5
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PCBP2Q15366 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.993e-8■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.983e-8■■■□□ 18.5
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PCBP2Q15366 STX4-215ENST00000565483 846 ntTSL 520.12■□□□□ 0.813e-8■■■□□ 18.5
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PCBP2Q15366 STX4-208ENST00000478150 545 ntTSL 416.94■□□□□ 0.33e-8■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 AFF4-209ENST00000491831 1667 ntTSL 1 (best)16.3■□□□□ 0.23e-7■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.153e-7■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 AFF4-203ENST00000378595 3348 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.573e-7■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 AFF4-207ENST00000477369 728 ntTSL 58.72□□□□□ -1.013e-7■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 AFF4-202ENST00000378593 430 ntTSL 56.65□□□□□ -1.343e-7■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 AFF4-205ENST00000425658 513 ntTSL 55.4□□□□□ -1.543e-7■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.641e-8■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 POU2F1-208ENST00000443275 12939 ntTSL 1 (best)4.57□□□□□ -1.681e-8■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 PHF21A-202ENST00000418153 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.552e-6■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 PHF21A-201ENST00000323180 3675 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.092e-6■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.88■□□□□ 0.298e-7■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.582e-6■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 MTMR4-209ENST00000583656 810 ntTSL 322.68■■□□□ 1.223e-7■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 MTMR4-206ENST00000582390 1281 ntTSL 522.68■■□□□ 1.223e-7■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 MTMR4-203ENST00000579921 425 ntTSL 513.03□□□□□ -0.323e-7■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 MTMR4-208ENST00000583243 317 ntTSL 210.69□□□□□ -0.73e-7■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 MTMR4-207ENST00000582663 572 ntTSL 49.21□□□□□ -0.943e-7■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC3.1□□□□□ -1.912e-50■■■□□ 18.5
PCBP2Q15366 DCTN1-225ENST00000497666 479 ntTSL 315.3■□□□□ 0.044e-15■■■□□ 18.4
PCBP2Q15366 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.014e-15■■■□□ 18.4
PCBP2Q15366 DCTN1-221ENST00000491465 2444 ntTSL 1 (best)14.68□□□□□ -0.064e-15■■■□□ 18.4
PCBP2Q15366 DCTN1-210ENST00000434055 4229 ntTSL 212.54□□□□□ -0.44e-15■■■□□ 18.4
PCBP2Q15366 DCTN1-218ENST00000466110 5414 ntTSL 212.39□□□□□ -0.434e-15■■■□□ 18.4
PCBP2Q15366 DCTN1-206ENST00000409868 4202 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.54e-15■■■□□ 18.4
PCBP2Q15366 DCTN1-227ENST00000633691 4160 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.624e-15■■■□□ 18.4
PCBP2Q15366 DCTN1-201ENST00000361874 4500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.624e-15■■■□□ 18.4
PCBP2Q15366 DCTN1-202ENST00000394003 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.714e-15■■■□□ 18.4
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