RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566353.5

STX4-216, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STX4, Length 696 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-216ENST00000566353 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.01■■■■■ 6.08
STX4-216ENST00000566353 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.66■■■■■ 5.22
STX4-216ENST00000566353 ABCC9O60706 1549 aa47.59■■■■■ 5.21
STX4-216ENST00000566353 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.33■■■■■ 4.85
STX4-216ENST00000566353 NACADO15069 1562 aa45■■■■■ 4.79
STX4-216ENST00000566353 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.62■■■■■ 4.73
STX4-216ENST00000566353 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.58■■■■■ 4.73
STX4-216ENST00000566353 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.38■■■■■ 4.69
STX4-216ENST00000566353 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.36■■■■■ 4.69
STX4-216ENST00000566353 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.23■■■■■ 4.67
STX4-216ENST00000566353 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.01■■■■■ 4.64
STX4-216ENST00000566353 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.96■■■■■ 4.63
STX4-216ENST00000566353 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.8■■■■■ 4.6
STX4-216ENST00000566353 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.44■■■■■ 4.54
STX4-216ENST00000566353 SCRIBQ14160 1630 aa43.39■■■■■ 4.54
STX4-216ENST00000566353 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.03■■■■■ 4.48
STX4-216ENST00000566353 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.93■■■■■ 4.46
STX4-216ENST00000566353 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.87■■■■■ 4.45
STX4-216ENST00000566353 NCAPD3P42695 1498 aa41.51■■■■■ 4.24
STX4-216ENST00000566353 SMARCA4P51532 1647 aa41.39■■■■■ 4.22
STX4-216ENST00000566353 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.39■■■■■ 4.22
STX4-216ENST00000566353 SMARCA2P51531 1590 aa41.3■■■■■ 4.2
STX4-216ENST00000566353 HMGXB3Q12766 1538 aa41.26■■■■■ 4.2
STX4-216ENST00000566353 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.16■■■■■ 4.18
STX4-216ENST00000566353 ERCC6Q03468 1493 aa41.09■■■■■ 4.17
STX4-216ENST00000566353 CUX2O14529 1486 aa41.04■■■■■ 4.16
STX4-216ENST00000566353 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
STX4-216ENST00000566353 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.99■■■■■ 4.15
STX4-216ENST00000566353 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.96■■■■■ 4.15
STX4-216ENST00000566353 NESP48681 1621 aa40.88■■■■■ 4.13
STX4-216ENST00000566353 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.84■■■■■ 4.13
STX4-216ENST00000566353 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.63■■■■■ 4.09
STX4-216ENST00000566353 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.54■■■■■ 4.08
STX4-216ENST00000566353 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.42■■■■■ 4.06
STX4-216ENST00000566353 WIZO95785 1651 aa40.37■■■■■ 4.05
STX4-216ENST00000566353 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.33■■■■■ 4.05
STX4-216ENST00000566353 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.23■■■■■ 4.03
STX4-216ENST00000566353 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.03■■■■■ 4
STX4-216ENST00000566353 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.96■■■■□ 3.99
STX4-216ENST00000566353 WDR62O43379 1518 aa39.96■■■■□ 3.99
STX4-216ENST00000566353 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.87■■■■□ 3.97
STX4-216ENST00000566353 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.87■■■■□ 3.97
STX4-216ENST00000566353 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.81■■■■□ 3.96
STX4-216ENST00000566353 CFTRP13569 1480 aa39.79■■■■□ 3.96
STX4-216ENST00000566353 PRDM2Q13029 1718 aa39.51■■■■□ 3.92
STX4-216ENST00000566353 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.5■■■■□ 3.91
STX4-216ENST00000566353 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.37■■■■□ 3.89
STX4-216ENST00000566353 TRIM41Q8WV44 630 aa39.16■■■■□ 3.86
STX4-216ENST00000566353 OSCARQ8IYS5 282 aa39.07■■■■□ 3.85
STX4-216ENST00000566353 IFT140Q96RY7 1462 aa39.06■■■■□ 3.84
STX4-216ENST00000566353 TOPBP1Q92547 1522 aa39.06■■■■□ 3.84
STX4-216ENST00000566353 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.99■■■■□ 3.83
STX4-216ENST00000566353 ABCC8Q09428 1581 aa38.96■■■■□ 3.83
STX4-216ENST00000566353 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.95■■■■□ 3.83
STX4-216ENST00000566353 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.85■■■■□ 3.81
STX4-216ENST00000566353 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.74■■■■□ 3.79
STX4-216ENST00000566353 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.7■■■■□ 3.79
STX4-216ENST00000566353 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.7■■■■□ 3.79
STX4-216ENST00000566353 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.7■■■■□ 3.79
STX4-216ENST00000566353 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.66■■■■□ 3.78
STX4-216ENST00000566353 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.6■■■■□ 3.77
STX4-216ENST00000566353 CHD1O14646 1710 aa38.58■■■■□ 3.77
STX4-216ENST00000566353 ARHGEF11O15085 1522 aa38.54■■■■□ 3.76
STX4-216ENST00000566353 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.49■■■■□ 3.75
STX4-216ENST00000566353 SOGA1O94964 1423 aa38.44■■■■□ 3.74
STX4-216ENST00000566353 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.42■■■■□ 3.74
STX4-216ENST00000566353 CUX1P39880 1505 aa38.38■■■■□ 3.74
STX4-216ENST00000566353 WDR97A6NE52 1622 aa38.38■■■■□ 3.73
STX4-216ENST00000566353 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.35■■■■□ 3.73
STX4-216ENST00000566353 FBLN2P98095 1184 aa38.31■■■■□ 3.72
STX4-216ENST00000566353 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.27■■■■□ 3.72
STX4-216ENST00000566353 ARAP1Q96P48 1450 aa38.16■■■■□ 3.7
STX4-216ENST00000566353 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.16■■■■□ 3.7
STX4-216ENST00000566353 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.16■■■■□ 3.7
STX4-216ENST00000566353 GRIN2BQ13224 1484 aa38.14■■■■□ 3.7
STX4-216ENST00000566353 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.11■■■■□ 3.69
STX4-216ENST00000566353 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.1■■■■□ 3.69
STX4-216ENST00000566353 PBRM1Q86U86 1689 aa38.07■■■■□ 3.69
STX4-216ENST00000566353 SYNJ1O43426 1573 aa38.07■■■■□ 3.69
STX4-216ENST00000566353 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.04■■■■□ 3.68
STX4-216ENST00000566353 SYNJ2O15056 1496 aa38.03■■■■□ 3.68
STX4-216ENST00000566353 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.99■■■■□ 3.67
STX4-216ENST00000566353 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.98■■■■□ 3.67
STX4-216ENST00000566353 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.97■■■■□ 3.67
STX4-216ENST00000566353 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.82■■■■□ 3.64
STX4-216ENST00000566353 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.78■■■■□ 3.64
STX4-216ENST00000566353 TOP2BQ02880 1626 aa37.78■■■■□ 3.64
STX4-216ENST00000566353 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.75■■■■□ 3.63
STX4-216ENST00000566353 ADAMTS12P58397 1594 aa37.69■■■■□ 3.62
STX4-216ENST00000566353 GRIN2AQ12879 1464 aa37.66■■■■□ 3.62
STX4-216ENST00000566353 CEP170Q5SW79 1584 aa37.56■■■■□ 3.6
STX4-216ENST00000566353 NUP160Q12769 1436 aa37.53■■■■□ 3.6
STX4-216ENST00000566353 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.52■■■■□ 3.6
STX4-216ENST00000566353 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.51■■■■□ 3.6
STX4-216ENST00000566353 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.49■■■■□ 3.59
STX4-216ENST00000566353 SHROOM2Q13796 1616 aa37.42■■■■□ 3.58
STX4-216ENST00000566353 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.17■■■■□ 3.54
STX4-216ENST00000566353 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.15■■■■□ 3.54
STX4-216ENST00000566353 JPH4Q96JJ6 628 aa37.06■■■■□ 3.52
STX4-216ENST00000566353 CUL7Q14999 1698 aa37.01■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms