RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460668.5

STX4-204, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 3

Gene STX4, Length 842 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-204ENST00000460668 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.99■■■■■ 7.19
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STX4-204ENST00000460668 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.35■■■■■ 5.65
STX4-204ENST00000460668 NACADO15069 1562 aa50.26■■■■■ 5.64
STX4-204ENST00000460668 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.2■■■■■ 5.63
STX4-204ENST00000460668 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.91■■■■■ 5.58
STX4-204ENST00000460668 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.9■■■■■ 5.58
STX4-204ENST00000460668 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.61■■■■■ 5.53
STX4-204ENST00000460668 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.28■■■■■ 5.48
STX4-204ENST00000460668 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.04■■■■■ 5.44
STX4-204ENST00000460668 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.9■■■■■ 5.42
STX4-204ENST00000460668 SCRIBQ14160 1630 aa48.71■■■■■ 5.39
STX4-204ENST00000460668 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.44■■■■■ 5.34
STX4-204ENST00000460668 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.29■■■■■ 5.32
STX4-204ENST00000460668 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.59■■■■■ 5.21
STX4-204ENST00000460668 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.46■■■■■ 5.19
STX4-204ENST00000460668 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.17■■■■■ 5.14
STX4-204ENST00000460668 SMARCA4P51532 1647 aa46.57■■■■■ 5.05
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STX4-204ENST00000460668 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.4■■■■■ 5.02
STX4-204ENST00000460668 SMARCA2P51531 1590 aa46.3■■■■■ 5
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STX4-204ENST00000460668 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.13■■■■■ 4.98
STX4-204ENST00000460668 HMGXB3Q12766 1538 aa46.13■■■■■ 4.97
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STX4-204ENST00000460668 ERCC6Q03468 1493 aa45.21■■■■■ 4.83
STX4-204ENST00000460668 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.2■■■■■ 4.83
STX4-204ENST00000460668 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.18■■■■■ 4.82
STX4-204ENST00000460668 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.04■■■■■ 4.8
STX4-204ENST00000460668 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.89■■■■■ 4.78
STX4-204ENST00000460668 CUX2O14529 1486 aa44.83■■■■■ 4.77
STX4-204ENST00000460668 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.81■■■■■ 4.76
STX4-204ENST00000460668 CFTRP13569 1480 aa44.72■■■■■ 4.75
STX4-204ENST00000460668 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.7■■■■■ 4.75
STX4-204ENST00000460668 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.7■■■■■ 4.75
STX4-204ENST00000460668 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.51■■■■■ 4.72
STX4-204ENST00000460668 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.45■■■■■ 4.71
STX4-204ENST00000460668 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.45■■■■■ 4.71
STX4-204ENST00000460668 PRDM2Q13029 1718 aa44.35■■■■■ 4.69
STX4-204ENST00000460668 WDR62O43379 1518 aa44.31■■■■■ 4.68
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STX4-204ENST00000460668 TOPBP1Q92547 1522 aa43.78■■■■■ 4.6
STX4-204ENST00000460668 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.77■■■■■ 4.6
STX4-204ENST00000460668 ABCC8Q09428 1581 aa43.74■■■■■ 4.59
STX4-204ENST00000460668 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.7■■■■■ 4.59
STX4-204ENST00000460668 IFT140Q96RY7 1462 aa43.55■■■■■ 4.56
STX4-204ENST00000460668 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.4■■■■■ 4.54
STX4-204ENST00000460668 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.39■■■■■ 4.54
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STX4-204ENST00000460668 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.25■■■■■ 4.51
STX4-204ENST00000460668 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.23■■■■■ 4.51
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STX4-204ENST00000460668 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.02■■■■■ 4.48
STX4-204ENST00000460668 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.01■■■■■ 4.48
STX4-204ENST00000460668 OSCARQ8IYS5 282 aa42.97■■■■■ 4.47
STX4-204ENST00000460668 TOP2BQ02880 1626 aa42.93■■■■■ 4.46
STX4-204ENST00000460668 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.93■■■■■ 4.46
STX4-204ENST00000460668 WDR97A6NE52 1622 aa42.93■■■■■ 4.46
STX4-204ENST00000460668 SYNJ1O43426 1573 aa42.92■■■■■ 4.46
STX4-204ENST00000460668 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.83■■■■■ 4.45
STX4-204ENST00000460668 GRIN2BQ13224 1484 aa42.72■■■■■ 4.43
STX4-204ENST00000460668 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.7■■■■■ 4.43
STX4-204ENST00000460668 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.7■■■■■ 4.43
STX4-204ENST00000460668 CHD1O14646 1710 aa42.7■■■■■ 4.43
STX4-204ENST00000460668 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.67■■■■■ 4.42
STX4-204ENST00000460668 FBLN2P98095 1184 aa42.63■■■■■ 4.41
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STX4-204ENST00000460668 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.48■■■■■ 4.39
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STX4-204ENST00000460668 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.29■■■■■ 4.36
STX4-204ENST00000460668 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.29■■■■■ 4.36
STX4-204ENST00000460668 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.29■■■■■ 4.36
STX4-204ENST00000460668 ADAMTS12P58397 1594 aa42.27■■■■■ 4.36
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STX4-204ENST00000460668 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.2■■■■■ 4.35
STX4-204ENST00000460668 TRIM41Q8WV44 630 aa42.2■■■■■ 4.35
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STX4-204ENST00000460668 KIF27Q86VH2 1401 aa42.12■■■■■ 4.33
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STX4-204ENST00000460668 NUP160Q12769 1436 aa42.02■■■■■ 4.32
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STX4-204ENST00000460668 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.75■■■■■ 4.27
STX4-204ENST00000460668 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.73■■■■■ 4.27
STX4-204ENST00000460668 SHROOM2Q13796 1616 aa41.72■■■■■ 4.27
STX4-204ENST00000460668 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.66■■■■■ 4.26
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