RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478150.1

STX4-208, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 4

Gene STX4, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-208ENST00000478150 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.88■■■■■ 4.61
STX4-208ENST00000478150 ABCC9O60706 1549 aa39.28■■■■□ 3.88
STX4-208ENST00000478150 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.12■■■■□ 3.85
STX4-208ENST00000478150 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.32■■■■□ 3.56
STX4-208ENST00000478150 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.15■■■■□ 3.54
STX4-208ENST00000478150 NACADO15069 1562 aa36.98■■■■□ 3.51
STX4-208ENST00000478150 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.78■■■■□ 3.48
STX4-208ENST00000478150 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.54■■■■□ 3.44
STX4-208ENST00000478150 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.52■■■■□ 3.44
STX4-208ENST00000478150 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
STX4-208ENST00000478150 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.32■■■■□ 3.4
STX4-208ENST00000478150 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.29■■■■□ 3.4
STX4-208ENST00000478150 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.1■■■■□ 3.37
STX4-208ENST00000478150 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.78■■■■□ 3.32
STX4-208ENST00000478150 SCRIBQ14160 1630 aa35.68■■■■□ 3.3
STX4-208ENST00000478150 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.48■■■■□ 3.27
STX4-208ENST00000478150 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.47■■■■□ 3.27
STX4-208ENST00000478150 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
STX4-208ENST00000478150 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.54■■■■□ 3.12
STX4-208ENST00000478150 CUX2O14529 1486 aa34.13■■■■□ 3.05
STX4-208ENST00000478150 NCAPD3P42695 1498 aa34.13■■■■□ 3.05
STX4-208ENST00000478150 SMARCA4P51532 1647 aa34.1■■■■□ 3.05
STX4-208ENST00000478150 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.04■■■■□ 3.04
STX4-208ENST00000478150 ERCC6Q03468 1493 aa34.04■■■■□ 3.04
STX4-208ENST00000478150 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.97■■■■□ 3.03
STX4-208ENST00000478150 SMARCA2P51531 1590 aa33.94■■■■□ 3.02
STX4-208ENST00000478150 HMGXB3Q12766 1538 aa33.82■■■■□ 3
STX4-208ENST00000478150 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.8■■■■□ 3
STX4-208ENST00000478150 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.77■■■■□ 3
STX4-208ENST00000478150 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.99
STX4-208ENST00000478150 NESP48681 1621 aa33.59■■■□□ 2.97
STX4-208ENST00000478150 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.42■■■□□ 2.94
STX4-208ENST00000478150 WIZO95785 1651 aa33.42■■■□□ 2.94
STX4-208ENST00000478150 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
STX4-208ENST00000478150 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.33■■■□□ 2.93
STX4-208ENST00000478150 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.3■■■□□ 2.92
STX4-208ENST00000478150 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.15■■■□□ 2.9
STX4-208ENST00000478150 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.09■■■□□ 2.89
STX4-208ENST00000478150 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.89
STX4-208ENST00000478150 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.96■■■□□ 2.87
STX4-208ENST00000478150 WDR62O43379 1518 aa32.86■■■□□ 2.85
STX4-208ENST00000478150 TRIM41Q8WV44 630 aa32.82■■■□□ 2.84
STX4-208ENST00000478150 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.75■■■□□ 2.83
STX4-208ENST00000478150 CFTRP13569 1480 aa32.74■■■□□ 2.83
STX4-208ENST00000478150 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.67■■■□□ 2.82
STX4-208ENST00000478150 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.67■■■□□ 2.82
STX4-208ENST00000478150 OSCARQ8IYS5 282 aa32.55■■■□□ 2.8
STX4-208ENST00000478150 PRDM2Q13029 1718 aa32.46■■■□□ 2.79
STX4-208ENST00000478150 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
STX4-208ENST00000478150 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
STX4-208ENST00000478150 IFT140Q96RY7 1462 aa32.15■■■□□ 2.74
STX4-208ENST00000478150 ABCC8Q09428 1581 aa32.07■■■□□ 2.72
STX4-208ENST00000478150 TOPBP1Q92547 1522 aa32.07■■■□□ 2.72
STX4-208ENST00000478150 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.02■■■□□ 2.72
STX4-208ENST00000478150 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.02■■■□□ 2.72
STX4-208ENST00000478150 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.02■■■□□ 2.72
STX4-208ENST00000478150 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.02■■■□□ 2.72
STX4-208ENST00000478150 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.01■■■□□ 2.72
STX4-208ENST00000478150 ARHGEF11O15085 1522 aa31.9■■■□□ 2.7
STX4-208ENST00000478150 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.83■■■□□ 2.69
STX4-208ENST00000478150 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
STX4-208ENST00000478150 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.75■■■□□ 2.67
STX4-208ENST00000478150 CUX1P39880 1505 aa31.73■■■□□ 2.67
STX4-208ENST00000478150 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
STX4-208ENST00000478150 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.72■■■□□ 2.67
STX4-208ENST00000478150 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.67■■■□□ 2.66
STX4-208ENST00000478150 FBLN2P98095 1184 aa31.67■■■□□ 2.66
STX4-208ENST00000478150 CHD1O14646 1710 aa31.66■■■□□ 2.66
STX4-208ENST00000478150 SOGA1O94964 1423 aa31.66■■■□□ 2.66
STX4-208ENST00000478150 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.64■■■□□ 2.66
STX4-208ENST00000478150 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
STX4-208ENST00000478150 ARAP1Q96P48 1450 aa31.53■■■□□ 2.64
STX4-208ENST00000478150 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
STX4-208ENST00000478150 WDR97A6NE52 1622 aa31.49■■■□□ 2.63
STX4-208ENST00000478150 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.46■■■□□ 2.63
STX4-208ENST00000478150 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
STX4-208ENST00000478150 TOP2BQ02880 1626 aa31.4■■■□□ 2.62
STX4-208ENST00000478150 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.38■■■□□ 2.61
STX4-208ENST00000478150 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.38■■■□□ 2.61
STX4-208ENST00000478150 SYNJ1O43426 1573 aa31.37■■■□□ 2.61
STX4-208ENST00000478150 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
STX4-208ENST00000478150 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.35■■■□□ 2.61
STX4-208ENST00000478150 GRIN2BQ13224 1484 aa31.32■■■□□ 2.6
STX4-208ENST00000478150 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.31■■■□□ 2.6
STX4-208ENST00000478150 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.28■■■□□ 2.6
STX4-208ENST00000478150 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.24■■■□□ 2.59
STX4-208ENST00000478150 SYNJ2O15056 1496 aa31.24■■■□□ 2.59
STX4-208ENST00000478150 PBRM1Q86U86 1689 aa31.21■■■□□ 2.59
STX4-208ENST00000478150 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
STX4-208ENST00000478150 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.98■■■□□ 2.55
STX4-208ENST00000478150 ADAMTS12P58397 1594 aa30.96■■■□□ 2.55
STX4-208ENST00000478150 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.92■■■□□ 2.54
STX4-208ENST00000478150 GRIN2AQ12879 1464 aa30.91■■■□□ 2.54
STX4-208ENST00000478150 KIF27Q86VH2 1401 aa30.83■■■□□ 2.53
STX4-208ENST00000478150 NUP160Q12769 1436 aa30.78■■■□□ 2.52
STX4-208ENST00000478150 CEP170Q5SW79 1584 aa30.75■■■□□ 2.51
STX4-208ENST00000478150 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.71■■■□□ 2.51
STX4-208ENST00000478150 IGF1RP08069 1367 aa30.71■■■□□ 2.51
STX4-208ENST00000478150 SHROOM2Q13796 1616 aa30.66■■■□□ 2.5
STX4-208ENST00000478150 CUL7Q14999 1698 aa30.65■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.4 ms