Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.124e-12■■□□□ 11.7
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PABPC4Q13310 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.14e-12■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.14e-12■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.855e-8■■□□□ 11.7
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PABPC4Q13310 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.176e-8■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.154e-7■■□□□ 11.7
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PABPC4Q13310 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.066e-8■■□□□ 11.7
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PABPC4Q13310 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.891e-6■■□□□ 11.7
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PABPC4Q13310 FURIN-201ENST00000268171 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.138e-8■■□□□ 11.7
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PABPC4Q13310 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.213e-8■■□□□ 11.7
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PABPC4Q13310 PPP2CB-208ENST00000522113 236 ntTSL 36.22□□□□□ -1.412e-9■■□□□ 11.7
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PABPC4Q13310 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.158e-10■■□□□ 11.7
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PABPC4Q13310 ZPR1-204ENST00000429220 2364 ntTSL 516.93■□□□□ 0.39e-12■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 ZPR1-206ENST00000444935 2497 ntTSL 512.73□□□□□ -0.379e-12■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 ZPR1-201ENST00000227322 6566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.469e-12■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.142e-85■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 TUBA1B-201ENST00000332858 3198 ntTSL 1 (best)14.81□□□□□ -0.042e-85■■□□□ 11.7
PABPC4Q13310 TUBA1B-204ENST00000547765 1875 ntTSL 514.52□□□□□ -0.092e-85■■□□□ 11.7
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PABPC4Q13310 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.141e-6■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 HNRNPH3-211ENST00000491200 2308 ntTSL 1 (best)15.59■□□□□ 0.091e-6■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 12e-6■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 VARS-222ENST00000470953 392 ntTSL 37.35□□□□□ -1.235e-9■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 DCAF7-202ENST00000431926 1354 ntTSL 1 (best)17.59■□□□□ 0.412e-9■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 DCAF7-203ENST00000580091 325 ntTSL 312.29□□□□□ -0.442e-9■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 DCAF7-205ENST00000614556 6340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.562e-9■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.221e-6■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 MYO18A-212ENST00000531892 599 ntTSL 313.44□□□□□ -0.263e-7■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 MYO18A-211ENST00000531438 565 ntTSL 412.23□□□□□ -0.453e-7■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 IMPDH2-212ENST00000496837 760 ntTSL 218.17■□□□□ 0.54e-13■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 SSR3-204ENST00000467733 873 ntTSL 25.14□□□□□ -1.596e-9■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.131e-16■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.161e-16■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.471e-16■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 HDAC2-215ENST00000523334 4810 ntTSL 24.33□□□□□ -1.721e-16■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 KRT19-207ENST00000593096 728 ntTSL 318.83■□□□□ 0.66e-7■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 EIF3E-210ENST00000521297 223 ntTSL 54.29□□□□□ -1.721e-14■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 TMEM14C-203ENST00000467415 899 ntTSL 317.07■□□□□ 0.327e-28■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.277e-28■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.197e-28■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 FHL3-202ENST00000475084 882 ntTSL 522.6■■□□□ 1.212e-10■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.967e-43■■□□□ 11.6
PABPC4Q13310 SLC25A39-216ENST00000592857 837 ntTSL 325.53■■□□□ 1.682e-20■■□□□ 11.6
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