Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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FOXF1Q12946 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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FOXF1Q12946 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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FOXF1Q12946 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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FOXF1Q12946 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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FOXF1Q12946 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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FOXF1Q12946 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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