Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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TRAF2Q12933 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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