Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms