Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELF3P78545 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELF3P78545 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELF3P78545 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELF3P78545 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELF3P78545 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELF3P78545 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELF3P78545 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELF3P78545 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELF3P78545 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELF3P78545 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELF3P78545 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELF3P78545 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELF3P78545 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELF3P78545 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELF3P78545 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELF3P78545 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELF3P78545 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELF3P78545 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELF3P78545 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELF3P78545 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELF3P78545 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ELF3P78545 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ELF3P78545 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF3P78545 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF3P78545 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF3P78545 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF3P78545 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF3P78545 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF3P78545 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF3P78545 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF3P78545 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF3P78545 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF3P78545 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF3P78545 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF3P78545 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF3P78545 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF3P78545 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF3P78545 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF3P78545 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF3P78545 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF3P78545 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF3P78545 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF3P78545 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF3P78545 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF3P78545 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF3P78545 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF3P78545 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF3P78545 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF3P78545 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF3P78545 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF3P78545 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF3P78545 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF3P78545 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ELF3P78545 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms