Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVDP53602 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVDP53602 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVDP53602 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MVDP53602 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MVDP53602 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVDP53602 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVDP53602 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MVDP53602 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVDP53602 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVDP53602 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVDP53602 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVDP53602 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVDP53602 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVDP53602 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVDP53602 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms