Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJA4P35212 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GJA4P35212 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GJA4P35212 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GJA4P35212 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GJA4P35212 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GJA4P35212 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GJA4P35212 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GJA4P35212 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
GJA4P35212 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GJA4P35212 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJA4P35212 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJA4P35212 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms