Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 A1CF-203ENST00000373995 2211 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CCT7P1-201ENST00000406551 1611 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms