Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SS18Q15532 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SS18Q15532 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SS18Q15532 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms