Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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SPIDRQ14159 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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SPIDRQ14159 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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SPIDRQ14159 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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SPIDRQ14159 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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SPIDRQ14159 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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SPIDRQ14159 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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SPIDRQ14159 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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SPIDRQ14159 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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