Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SELENBP1Q13228 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms