Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K2

KLHL30, Kelch-like protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL30Q0D2K2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL30Q0D2K2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms