Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD47Q08722 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD47Q08722 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD47Q08722 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms