Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCLMP48507 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCLMP48507 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCLMP48507 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCLMP48507 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCLMP48507 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCLMP48507 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCLMP48507 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCLMP48507 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCLMP48507 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms