Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCR1P46094 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCR1P46094 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XCR1P46094 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms