Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PPARGP37231 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPARGP37231 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms