Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.991e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 SMG1P3-202ENST00000437413 589 ntTSL 420.91■□□□□ 0.943e-15■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 TSTA3-214ENST00000531473 2220 ntTSL 1 (best)20.88■□□□□ 0.931e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.931e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 TSTA3-215ENST00000532308 951 ntTSL 519.94■□□□□ 0.781e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.731e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 CDC37-207ENST00000589755 793 ntTSL 219.55■□□□□ 0.721e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.521e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 CDC37-210ENST00000593124 1389 ntTSL 518.28■□□□□ 0.521e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 SPPL3-208ENST00000543854 508 ntTSL 518.21■□□□□ 0.511e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 KIFC2-202ENST00000529644 695 ntTSL 317.77■□□□□ 0.441e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.431e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.41e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 MZT2A-202ENST00000410036 382 ntTSL 517.12■□□□□ 0.331e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 SMG1P3-201ENST00000435197 416 ntTSL 317.08■□□□□ 0.323e-15■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.261e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.251e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 CDC37-202ENST00000588498 690 ntTSL 316.43■□□□□ 0.221e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 ZSCAN29-205ENST00000563508 701 ntTSL 316.34■□□□□ 0.211e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 MZT2A-203ENST00000427024 679 ntTSL 316.16■□□□□ 0.181e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 CDC37-203ENST00000588869 966 ntTSL 515.78■□□□□ 0.121e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 SPPL3-207ENST00000543608 636 ntTSL 315.46■□□□□ 0.071e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 RBBP6-210ENST00000568015 695 ntTSL 315.34■□□□□ 0.051e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 EIF4G2-218ENST00000531416 1969 ntTSL 215.3■□□□□ 0.041e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.011e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.071e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 CDC37-209ENST00000591248 1377 ntTSL 514.57□□□□□ -0.081e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 ABAT-212ENST00000566590 2423 ntTSL 1 (best)14.42□□□□□ -0.11e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 CDC37-206ENST00000589629 728 ntTSL 314.24□□□□□ -0.131e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 TSTA3-216ENST00000533817 871 ntTSL 314.08□□□□□ -0.161e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 MZT2A-205ENST00000488586 234 ntTSL 514.06□□□□□ -0.161e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 ERICH1-207ENST00000522893 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13.94□□□□□ -0.182e-10■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.181e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 PSME1-207ENST00000560420 922 ntTSL 213.91□□□□□ -0.181e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 NDUFA13-206ENST00000511584 640 ntTSL 213.88□□□□□ -0.191e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 SPPL3-204ENST00000536996 763 ntTSL 513.76□□□□□ -0.211e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.211e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 TSTA3-209ENST00000529048 869 ntTSL 513.66□□□□□ -0.221e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 TSTA3-212ENST00000530474 823 ntTSL 512.95□□□□□ -0.341e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 XYLB-204ENST00000472721 546 ntTSL 412.81□□□□□ -0.361e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 PSME1-208ENST00000561059 947 ntTSL 212.68□□□□□ -0.381e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 PSME1-209ENST00000561142 865 ntTSL 512.68□□□□□ -0.381e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.381e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 TSTA3-210ENST00000529064 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.421e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 EIF4G2-211ENST00000527526 555 ntTSL 412.23□□□□□ -0.451e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 EIF4G2-220ENST00000531647 579 ntTSL 412.23□□□□□ -0.451e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 RBM5-219ENST00000475590 704 ntTSL 212.19□□□□□ -0.461e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 COL18A1-206ENST00000459895 588 ntTSL 312.17□□□□□ -0.462e-10■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 MYO1B-213ENST00000494129 1880 ntTSL 211.92□□□□□ -0.51e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 PSME1-210ENST00000561435 945 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.71e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 TTPAL-201ENST00000262605 6212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.731e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 PNN-203ENST00000554117 624 ntTSL 210.35□□□□□ -0.751e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 EXOC7-218ENST00000591724 353 ntTSL 510.19□□□□□ -0.783e-7■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 TTPAL-202ENST00000372904 6234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.781e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 EIF4G2-225ENST00000532383 6769 ntTSL 1 (best)10.12□□□□□ -0.791e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 CHMP4A-206ENST00000533011 733 ntTSL 59.66□□□□□ -0.861e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 EIF4G2-232ENST00000640650 2724 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.871e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 PSME1-206ENST00000559741 763 ntTSL 39.55□□□□□ -0.881e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 PSME1-204ENST00000558112 651 ntTSL 58.88□□□□□ -0.991e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 CHMP4A-205ENST00000531158 563 ntTSL 48.65□□□□□ -1.021e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 RBBP6-207ENST00000564314 3361 ntTSL 28.56□□□□□ -1.041e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 RBM5-213ENST00000464988 877 ntTSL 28.26□□□□□ -1.091e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.111e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.131e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 MYO1B-215ENST00000634375 567 ntTSL 47.72□□□□□ -1.171e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.211e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 TTPAL-204ENST00000456317 926 ntTSL 27.31□□□□□ -1.241e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 EIF4G2-227ENST00000533485 806 ntTSL 27.26□□□□□ -1.251e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 CHMP4A-209ENST00000542700 847 ntTSL 37.16□□□□□ -1.261e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 CHMP4A-210ENST00000552620 716 ntTSL 26.28□□□□□ -1.41e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 RBBP6-209ENST00000567686 1138 ntTSL 55.22□□□□□ -1.571e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 PSME1-203ENST00000470718 476 ntTSL 33.22□□□□□ -1.891e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.32e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 SLC7A5-203ENST00000565644 3983 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.552e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 DYNC1H1-201ENST00000360184 14333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.662e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 UTRN-208ENST00000433557 354 ntTSL 420.97■□□□□ 0.953e-7■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 UTRN-213ENST00000628146 597 ntTSL 23.98□□□□□ -1.773e-7■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.441e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.361e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.21e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.051e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.031e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 UBA1-206ENST00000442035 1054 ntTSL 520.14■□□□□ 0.815e-12■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 UBA1-208ENST00000457753 809 ntTSL 516.21■□□□□ 0.195e-12■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.075e-12■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 UBA1-204ENST00000412206 1148 ntTSL 514.36□□□□□ -0.115e-12■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 UBA1-205ENST00000427561 671 ntTSL 513.04□□□□□ -0.325e-12■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 UBA1-203ENST00000377351 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.865e-12■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.332e-8■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 HHEX-204ENST00000551454 1307 ntTSL 1 (best)19.74■□□□□ 0.752e-8■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.441e-7■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 SPTBN1-201ENST00000333896 9075 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.671e-7■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 SPTBN1-207ENST00000615901 10226 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.891e-7■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 ACSF2-221ENST00000512119 598 ntTSL 313.56□□□□□ -0.244e-9■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 ACSF2-205ENST00000503387 559 ntTSL 413.4□□□□□ -0.264e-9■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 CHRD-203ENST00000356534 1252 ntTSL 1 (best)19.49■□□□□ 0.712e-7■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 TAF1C-219ENST00000568265 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 418.83■□□□□ 0.62e-8■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.532e-8■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 TAF1C-208ENST00000563428 2531 ntTSL 217.13■□□□□ 0.332e-8■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 TAF1C-204ENST00000544090 2747 ntTSL 216.54■□□□□ 0.242e-8■□□□□ 9.5
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