RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262605.8

TTPAL-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-201ENST00000262605 NISCHQ9Y2I1 1504 aa20.19■□□□□ 0.82
TTPAL-201ENST00000262605 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.97■□□□□ 0.63
TTPAL-201ENST00000262605 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa18.29■□□□□ 0.52
TTPAL-201ENST00000262605 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
TTPAL-201ENST00000262605 ABCC9O60706 1549 aa17.17■□□□□ 0.34
TTPAL-201ENST00000262605 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.17■□□□□ 0.34
TTPAL-201ENST00000262605 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa16.99■□□□□ 0.31
TTPAL-201ENST00000262605 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
TTPAL-201ENST00000262605 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
TTPAL-201ENST00000262605 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP16.72■□□□□ 0.27
TTPAL-201ENST00000262605 TRIM41Q8WV44 630 aa16.68■□□□□ 0.26
TTPAL-201ENST00000262605 SCRIBQ14160 1630 aa16.64■□□□□ 0.25
TTPAL-201ENST00000262605 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
TTPAL-201ENST00000262605 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
TTPAL-201ENST00000262605 CHIC1Q5VXU3 224 aa16.46■□□□□ 0.22
TTPAL-201ENST00000262605 PCGF6Q9BYE7 350 aa16.33■□□□□ 0.2
TTPAL-201ENST00000262605 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa16.32■□□□□ 0.2
TTPAL-201ENST00000262605 UBTFP17480 764 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
TTPAL-201ENST00000262605 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa16.23■□□□□ 0.19
TTPAL-201ENST00000262605 APLP2Q06481 763 aa16.23■□□□□ 0.19
TTPAL-201ENST00000262605 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
TTPAL-201ENST00000262605 NACADO15069 1562 aa16.17■□□□□ 0.18
TTPAL-201ENST00000262605 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa16.1■□□□□ 0.17
TTPAL-201ENST00000262605 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TTPAL-201ENST00000262605 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TTPAL-201ENST00000262605 CECR2Q9BXF3 1484 aa15.91■□□□□ 0.14
TTPAL-201ENST00000262605 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
TTPAL-201ENST00000262605 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
TTPAL-201ENST00000262605 MYO15BQ96JP2 1530 aa15.75■□□□□ 0.11
TTPAL-201ENST00000262605 MROH2BQ7Z745 1585 aa15.73■□□□□ 0.11
TTPAL-201ENST00000262605 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
TTPAL-201ENST00000262605 ITGAEP38570 1179 aa15.65■□□□□ 0.1
TTPAL-201ENST00000262605 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
TTPAL-201ENST00000262605 WIZO95785 1651 aa15.63■□□□□ 0.09
TTPAL-201ENST00000262605 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.61■□□□□ 0.09
TTPAL-201ENST00000262605 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TTPAL-201ENST00000262605 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
TTPAL-201ENST00000262605 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
TTPAL-201ENST00000262605 HRCP23327 699 aa15.51■□□□□ 0.07
TTPAL-201ENST00000262605 P3H3Q8IVL6 736 aa15.5■□□□□ 0.07
TTPAL-201ENST00000262605 FBLN2P98095 1184 aa15.48■□□□□ 0.07
TTPAL-201ENST00000262605 CCDC88BA6NC98 1476 aa15.48■□□□□ 0.07
TTPAL-201ENST00000262605 SMARCA4P51532 1647 aa15.43■□□□□ 0.06
TTPAL-201ENST00000262605 ABCC8Q09428 1581 aa15.42■□□□□ 0.06
TTPAL-201ENST00000262605 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.41■□□□□ 0.06
TTPAL-201ENST00000262605 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
TTPAL-201ENST00000262605 ARID3CA6NKF2 412 aa15.37■□□□□ 0.05
TTPAL-201ENST00000262605 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
TTPAL-201ENST00000262605 SMARCA2P51531 1590 aa15.34■□□□□ 0.05
TTPAL-201ENST00000262605 SOGA1O94964 1423 aa15.28■□□□□ 0.04
TTPAL-201ENST00000262605 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa15.28■□□□□ 0.04
TTPAL-201ENST00000262605 MYT1LQ9UL68 1186 aa15.22■□□□□ 0.03
TTPAL-201ENST00000262605 GOLGA3Q08378 1498 aa15.2■□□□□ 0.02
TTPAL-201ENST00000262605 CEP162Q5TB80 1403 aa15.19■□□□□ 0.02
TTPAL-201ENST00000262605 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TTPAL-201ENST00000262605 CLIP1P30622 1438 aa15.17■□□□□ 0.02
TTPAL-201ENST00000262605 EEA1Q15075 1411 aa15.15■□□□□ 0.02
TTPAL-201ENST00000262605 KIF27Q86VH2 1401 aa15.13■□□□□ 0.01
TTPAL-201ENST00000262605 UNC13AQ9UPW8 1703 aa15.12■□□□□ 0.01
TTPAL-201ENST00000262605 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
TTPAL-201ENST00000262605 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.09■□□□□ 0.01
TTPAL-201ENST00000262605 NEUROD1Q13562 356 aa15.09■□□□□ 0.01
TTPAL-201ENST00000262605 BICRAQ9NZM4 1560 aa15.08■□□□□ 0.01
TTPAL-201ENST00000262605 TRIM52Q96A61 297 aa15.08■□□□□ 0.01
TTPAL-201ENST00000262605 ERCC6Q03468 1493 aa15.08■□□□□ 0.01
TTPAL-201ENST00000262605 CUX2O14529 1486 aa15.07■□□□□ 0
TTPAL-201ENST00000262605 TNIKQ9UKE5 1360 aa15.07■□□□□ 0
TTPAL-201ENST00000262605 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
TTPAL-201ENST00000262605 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.04■□□□□ -0
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
TTPAL-201ENST00000262605 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.01□□□□□ -0.01
TTPAL-201ENST00000262605 POLR3GLQ9BT43 218 aa15□□□□□ -0.01
TTPAL-201ENST00000262605 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
TTPAL-201ENST00000262605 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TTPAL-201ENST00000262605 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.95□□□□□ -0.02
TTPAL-201ENST00000262605 PDS5BQ9NTI5 1447 aa14.92□□□□□ -0.02
TTPAL-201ENST00000262605 NCAPD3P42695 1498 aa14.92□□□□□ -0.02
TTPAL-201ENST00000262605 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TTPAL-201ENST00000262605 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TTPAL-201ENST00000262605 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa14.92□□□□□ -0.02
TTPAL-201ENST00000262605 FANCD2Q9BXW9 1451 aa14.9□□□□□ -0.02
TTPAL-201ENST00000262605 CHIC2Q9UKJ5 165 aa14.89□□□□□ -0.03
TTPAL-201ENST00000262605 MTUS2Q5JR59 1369 aa14.88□□□□□ -0.03
TTPAL-201ENST00000262605 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TTPAL-201ENST00000262605 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa14.87□□□□□ -0.03
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TTPAL-201ENST00000262605 SYNJ1O43426 1573 aa14.82□□□□□ -0.04
TTPAL-201ENST00000262605 NESP48681 1621 aa14.81□□□□□ -0.04
TTPAL-201ENST00000262605 FGD5Q6ZNL6 1462 aa14.78□□□□□ -0.04
TTPAL-201ENST00000262605 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.78□□□□□ -0.04
TTPAL-201ENST00000262605 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TTPAL-201ENST00000262605 HMGXB3Q12766 1538 aa14.76□□□□□ -0.05
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TTPAL-201ENST00000262605 VPS8Q8N3P4 1428 aa14.75□□□□□ -0.05
TTPAL-201ENST00000262605 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.73□□□□□ -0.05
TTPAL-201ENST00000262605 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TTPAL-201ENST00000262605 DNAJC5BQ9UF47 199 aa14.73□□□□□ -0.05
TTPAL-201ENST00000262605 CFTRP13569 1480 aa14.72□□□□□ -0.05
TTPAL-201ENST00000262605 KCNH8Q96L42 1107 aa14.72□□□□□ -0.05
TTPAL-201ENST00000262605 FHOD3Q2V2M9 1422 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms