Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI09

NDUFA12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA12Q9UI09 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NDUFA12Q9UI09 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms